涟虫类系统发育的初步研究.doc

摘要:涟虫类属于动物界节肢动物门软甲纲，它是我国大多数经济鱼类的天然饵料[1]。近年来，科学家的研究重点对甲壳动物的系统发生关系研究稍有偏重，但对于软甲纲下物种研究较少，对于涟虫类的研究多偏向于群落生态学，在系统发生领域则几乎为空白。本文通过对从GenBank上检索到涟虫目现已测序部分物种共42种，选取其中5科6条18SrRNA基因序列及7科30条COⅠ基因序列进行分析，构建涟虫目已测序列种类的系统发育树。通过利用MEGA7.0软件计算涟虫目18SrRNA基因以及COⅠ基因序列片段的碱基组成、转换与颠换比值以及序列校正遗传距离[2]，并使用相邻连接(NJ)法、最大似然(ML)法和最大简约(MP)法构建了涟虫目的系统发育树，从而来达到研究涟虫类各物种同源性以及DNA序列相似性的目的[3]。实验结果显示，本次所构建的系统发育树与传统意义上的分类有所出入。

关键词：涟虫类　18SrRNA基因序列　COⅠ基因序列　系统发育

目录

摘要

Abstract

1.导言-1

1.1涟虫类分类地位-1

1.2研究现状-1

1.3研究目的与意义-3

2.材料与方法-3

2.1材料来源-3

2.2序列比对-4

2.3序列特征及遗传距离计算-5

2.4系统发育树的构建方法-5

3.结果与分析-6

3.1 涟虫目18SrRNA序列特征-6

3.2 涟虫目COⅠ序列特征-7

3.3涟虫类的系统发育树分析-10

4.结论与展望-15

参考文献-17

致谢-18