甲壳纲软甲亚纲系统发育的初步研究.doc

摘要:软甲亚纲是甲壳动物中数量最多，种类最多，经济价值最大的一个类群，包含大多数的虾蟹。在研究软甲亚纲生物的几十年里，我国获得了不少成绩，但仍然存在着很多问题和研究空白。相关于软甲亚纲生物的生态适应性和开发利用的研究较多，而对于软甲亚纲生物的分子进化和系统发育以及这一类群形成和发展过程的研究几乎为零。本文通过从NCBI上检索到的软甲亚纲部分基因序列，从中选取8目15条16SrRNA基因序列和8目15条CO1基因序列进行分析，构建软甲亚纲的系统发育树。通过15条软甲亚纲物种的碱基组成、转换与颠换比值、进化距离以及系统发育树的构建，研究软甲亚纲各物种同源性以及DNA序列多样性。

关键词:软甲亚纲；16SrRNA ；CO1 ；系统发育

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摘要

Abstract

1. 前  言-1

1.1 GenBank-1

1.2 分子钟假说-1

1.3 系统发育检验与线性树-1

1.4 系统发育树-2

1.5 研究的目的与意义-3

2. 科学研究-3

2.1研究背景-3

2.1.1软甲亚纲生物的研究现状-3

2.1.2系统发育的研究现状-3

2.2材料与方法-4

2.2.1基因序列下载-4

2.2.2基因序列分析-4

3. 结果与分析-4

3.1软甲亚纲部分基因序列的物种种类-4

3.2软甲亚纲CO1序列特征-5

3.2.1软甲亚纲部分物种CO1基因序列基因位点-5

3.2.2软甲亚纲部分物种CO1基因序列碱基组成-5

3.2.3软甲亚纲部分物种CO1基因序列进化距离-6

3.2.4软甲亚纲部分物种CO1基因序列碱基替换-6

3.3软甲亚纲16SrRNA序列特征-7

3.3.1软甲亚纲部分物种16SrRNA基因序列基因位点-7

3.3.2软甲亚纲部分物种16SrRNA基因序列碱基组成-7

3.3.3软甲亚纲部分物种16SrRNA基因序列进化距离-8

3.3.4软甲亚纲部分物种16SrRNA基因序列碱基替换-8

3.4软甲亚纲系统发育树分析-9

3.4.1软甲亚纲CO1基因序列系统发育树-10

3.4.2软甲亚纲16SrRNA基因序列系统发育树-13

3.5研究结论-16

致  谢-17

参考文献-18