Pseudomonas sp.LT1菌株基因组DNA提取及同源性分析.doc

摘要:假单胞菌广泛存在于自然界中，且生长条件非常低，种类繁多且利于培养。目前人类对假单胞菌的研究已非常深入，已经运用到生物防治、环境治理以及抗生素领域。假单胞菌不仅作用大，相比传统的方法来说价格也比较低廉，比如垃圾处理和植物病虫害的防治，在治理虫害的同时，还能改善植物周边的土壤，从而在根本上帮助植物的生长。本研究以实验室筛选的假单胞菌为研究材料，对该菌进行培养之后，用CTAB法对其进行提取基因组DNA，根据已知的Pseudomonas sp.菌株的基因序列设计引物对其进行PCR扩增。取PCR产物2-3μl进行电泳检测，其分子量大小确定为目标产物。对剩余的PCR产物进行电泳实验及凝胶回收，以纯化PCR产物。将最终的产物送至南京金斯瑞生物科技有限公司公司进行DNA测序。在NCBI网站上进行同源性比对，确定本实验室提取的菌种为Pseudomonas sp.LT1菌株不是新发现菌种。

关键词：假单胞菌；基因克隆；DNA测序；同源性分析

目录

摘要

Abstract

1 绪论-1

1.1 假单胞菌-1

1.1.1 假单胞菌的介绍-1

1.1.2 假单胞菌属的类别及特点-1

1.1.3 假单胞菌的应用-2

1.2 PCR-2

1.2.1 PCR技术的基本原理-2

1.2.2 影响PCR结果的要素-3

1.2.3 PCR技术的应用-4

1.2.4 关于PCR技术的发展前景-5

1.3 选题的背景及意义-5

2材料与方法-6

2.1 主要材料-6

2.1.1 培养基和其它试剂的配制-6

2.1.2 主要仪器-7

2.1.3 主要试剂-8

2.2 实验方法-9

2.2.1 实验菌的培养方法-9

2.2.2 基因组的提取方法-9

2.2.3 基因扩增-10

2.2.4 PCR产物回收-11

2.2.5 产物测序-11

3结果与讨论-11

3.1 实验菌基因组的提取-11

3.2 PCR产物鉴定-12

3.3 凝胶回收产物鉴定-13

3.4测序结果-14

结论-16

致谢-17

参考文献-18

附录-19