摘要:目的 优化测序反应体系,研究样品模板量对DNA测序反应结果的影响。 方法 采用单因素水平实验进行研究,将BigDye使用量固定为2μL、引物1ul、DNA模板根据日常研究工作依次选取浓度20 ng/μL、100 ng/μL、500 ng/μL,体积1μL、3μL、6μL分别进行测序反应,得到不同的实验结果,以信号强度、QV20+及连续读取长度为评判标准,对结果进行分析比较,得到最优的DNA模板测序使用量。 结果 本实验选定BigDye2μL、引物1ul、DNA模板浓度100 ng/μL,体积1μL为最优反应体系,以此体系得到的信号强度最强、QV20+值最高,并且连续读取长度最长。 结论 在测序引物纯度相对较好的情况下,样品模板浓度100 ng/μL,体积1μL对DNA测序反应结果更为准确可靠。
关键词:测序模板;DNA测序;结果影响
目录
摘要
Abstract
引 言1
1 材料与方法3
1.1 材料3
1.1.1 实验样本3
1.1.2试剂3
1.1.3仪器与设备3
1.2方法3
1.2.1DNA模板的制备3
1.2.1.1接菌3
1.2.1.2质粒的提取4
1.2.1.3质粒的检测4
1.2.2测序反应5
1.2.2.1DNA样本模板量的实验设计5
1.2.2.2测序PCR反应条件6
1.2.2.3PCR测序反应6
1.2.3纯化6
1.2.4上机测序6
2.实验结果6
2.1模板量对信号强度实验结果7
2.2模板量对测序精密度的影响7
2.3模板量对连续读取长度的影响8
3.分析与讨论10
4.结论12
参考文献13
致 谢15