植物KCO基因密码子使用特性分析.doc

摘要 ：本文以植物KCO基因为研究对象，运用CodonW软件分析了77个植物KCO基因密码子的使用模式。结果表明：表明碱基组成差异（r=0.961，P<0.01）和自然选择（r=0.568，P<0.01）是影响密码子使用的主要因素，并且高表达的基因强烈偏爱使用以G或C结尾的密码子。确定了UUC、CUC等26个密码子为植物KCO基因的高表达优越密码子，均已G/C结尾的密码子。

关键词：KCO基因；密码子偏好性；自然选择

同义密码子编码同一个氨基酸，如果没有任何选择压力和突变基因的偏倚，那么每个核苷酸位点上的核苷酸突变都是随机的，同义密码子出现的概率也是一样的。但是实际上，编码同一个氨基酸的不同的同义密码子通常具有不同频率，某些密码子比起其他同义密码子来说具有更高的使用频率。这种同义密码子使用的差异广泛地存在于细菌、真菌、植物、动物以及人类中，从某个单一物种基因组中的基因到不同的物种基因组，都可以发现某种密码子偏好的趋势，称为其同义密码子使用模式。同义密码子的使用偏好性与诸多生命活动过程如蛋白质的合成等有着密切联系，因此对同义密码子使用偏好性的研究具有重要的生物学意义。目前在密码子使用偏好性研究方面，主要集中在对已知全基因组序列的低等生物和模式生物的基因组密码子使用模式研究，对单一功能基因家族的密码子用法研究还比较少。本研究旨在通过分析植物KCO基因全长编码框密码子的使用特性，为深入研究其进化、表达调控机制等提供重要理论依据。