污泥干化芦苇床中芦苇内生菌群多样性研究.doc

摘要:本研究以污泥干化芦苇床中芦苇内生菌的多样性作为主要研究对象，利用16S rDNA高通量测序技术与PCR-DGGE技术相结合，设置实验组污泥干化芦苇床与对照组天然湿地中芦苇内生菌群多样性及微生物菌群进行了比较分析。研究发现，污泥干化芦苇床芦苇内生菌的细菌类群包含了20门、30纲、73目、152科、467属、1167种细菌。其中拟杆菌门(25.5%)占绝对优势和变形菌门(65.6%)，γ-变形菌门是丰度最高的纲占总数的43.4%；排前20位的优势菌种相对百分比之和为46.5%，分属于所对应的18个属、12科、10目、6纲、3门。通过DGGE分析对比，污泥干化芦苇床中的污泥优势菌群的种类与天然湿地有明显差距；由于污泥所产生的影响导致芦苇内生优势菌群种类发生与天然湿地不同的改变，由于优势菌群种类不同从而改变了内生菌的促生作用，实验组污泥干化芦苇床中芦苇根系更为发达。

关键词：芦苇内生菌；多样性；污泥干化芦苇床；16S rDNA高通量测序；DGGE

目录

摘要

Abstract

1 引言-1

2 材料和方法-2

2.1 实验样品-2

2.2 实验设计-2

2.3 测定方法-2

2.3.1 样品采集-2

2.3.2 微生物基因组DNA提取与纯化-3

2.3.3 16S rDNA生物信息学分析-4

2.3.4 PCR-DGGE-4

2.3.5 DGGE图谱分析方法-4

3 结果与分析-5

3.1 16S rDNA高通量测序-5

3.2 16S rDNA的DGGE指纹图谱分析-8

3.3 微生物群落DNA多样性指数分析-9

3.4 DGGE 图谱聚类分析-10

结    论-11

参考文献-12

致    谢-14