鲫鱼肠道可培养细菌种群多样性分析.doc

摘要:本文通过从健康鲫鱼肠道内分离细菌菌株，纯化培养各菌株。使用苯酚-氯仿抽提的方法，获得各菌株的基因组DNA。以细菌通用引物8F和1492R通过PCR方法扩增获得各菌株的16S rDNA序列，送到生物公司测序，将序列进行拼接，获得全序列，对菌株进行初步分类。结合实验室以前分离菌株的相关数据和新分离出的菌株，使用16S rDNA序列，确定健康鲫鱼肠道可培养菌株分别属于Aeromonas、Shewanella、Bacillus等，论文将相关菌株的种群特征进行了探讨。

关键词 ：鲫鱼；肠道；细菌；种群多样性

目录

摘要

Abstract

1绪论-1

1.1鱼类肠道细菌的研究-1

1.1.1 鱼类肠道细菌的简介-1

1.1.2鱼类肠道细菌的作用-1

1.1.3鱼类肠道菌群的特性、组成及数量-2

1.2 益生菌-2

1.2.1 益生菌对鲫鱼生长的影响-2

1.2.2益生菌的作用-3

1.3 本研究的意义-4

2实验材料和方法-5

2.1实验材料-5

2.1.1菌株来源-5

2.1.2药品-5

2.1.3 试剂-5

2.1.4 实验仪器-5

2.2实验步骤-6

2.2.1培养基的配置-6

2.2.2高压灭菌-7

2.2.3 鲫鱼肠道菌株的分离-8

2.2.4 菌株保藏-8

2.2.5 革兰氏染色和生理生化分析-9

2.2.6提取细菌组DNA为模板-10

2.2.7 进行PCR扩增16SrDNA-11

2.2.8 利用16S rDNA序列进行鉴定-11

2.2.9 确定肠道菌群的分类-11

3实验结果和讨论-13

3.1 分离到鲫鱼肠道可培养菌株-13

3.2 鲫鱼肠道菌株数目的确定-13

3.3 各菌株的16SrDNA序列-13

3.4 鲫鱼肠道菌群多样性特征-16

3.5 讨论-17

结论-18

致谢-19

参考文献-20