牛蒡根际可培养细菌种群多样性分析.doc

摘要:本文分析牛蒡根际可培养细菌有利于了解根际微生物多样性及其对牛蒡植株的影响，推动经济作物牛蒡资源的开发利用，并获得有价值的菌种资源。论文采用纯培养法，从我国牛蒡主产区徐州丰县的牛蒡根际土壤中分离可培养细菌，对其进行遗传多样性分析。限制性内切酶多态性分析显示，所分离的36株菌株可分为9个OUT。分离到的菌株分别属于变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteria）等3个门，分属于6个科，9个属，其中肠杆菌属（Enterobacter）、芽胞杆菌属（Bacillus）、假单胞菌属（Pseudomonas）是优势物种。结果表明：牛蒡根际微生物具有较高种群多样性，本文为开发适合牛蒡种植的微生物菌肥提供了基础资料。

关键词  牛蒡；根际；可培养细菌；微生物多样性

目录

摘要

Abstract

1  绪论-3

1.1 微生物分类学的研究进展-3

1.1.1 微生物分类的依据-3

1.1.2 微生物的分类系统-4

1.2 根际微生物类群的研究-5

1.2.1 根际微生物简介-5

1.2.2 植物根际微生物的特性和功能-5

1.2.3 植物根际微生物的研究进展-6

1.3. 根际微生物多样性与植株的关系-7

1.3.1 根际微生物多样性-7

1.3.2 根际微生物多样性对植株的影响-8

1.3.2.1 植物对根际微生物的影响-9

1.3.2.2 根际有害微生物对植物的影响-9

1.3.2.3 根际有益微生物对植物的影响-10

1.4 本研究的内容及意义-11

1.4.1 研究内容-11

1.4.2 研究意义-11

2 实验材料和方法-12

2.1 实验材料-12

2.1.1 实验植物-12

2.1.2 主要化学试剂及药品-12

2.1.3 主要仪器设备-12

2.2 实验方法-13

2.2.1 培养基及相关试剂的配制-13

2.2.2 高压灭菌及操作台的消毒-13

2.2.3 根际菌株分离与计数-13

2.2.4 基因组DNA的提取-14

2.2.5 电泳实验-15

2.2.6 菌株16S rDNA序列分析-16

2.2.6.1 引物的设计与合成-16

2.2.6.2 PCR扩增16S rDNA序列-16

2.2.6.3 16S rDNA序列的限制性酶切分析-17

2.2.6.4 16S rDNA序列的测序分析-17

3 实验结果和讨论-18

3.1菌株的筛选与计数-18

3.2 16S rDNA序列分析-18

3.3 系统发育关系分析-20

3.4 讨论-20

3.4.1 根际微生物多样性的研究展望-20

3.4.2 16s rDNA结果分析-21

3.4.3 植物根际微生物研究的意义-21

结论-23

致谢-24

参考文献-25