韭菜在天门冬目系统演化地位分析.doc

摘要:本文以核糖体DNA序列为分析对象，将实验获得的韭菜18S rRNA基因序列与美国国家生物信息中心GenBank数据库已有的天门冬目的一些物种的序列进行比较，分析了韭菜与天门冬目植物的系统演化关系。通过PCR方法扩增获得韭菜18S rRNA基因，测序获得1664bp 的DNA序列，GenBank 登录号是JF509958。将韭菜与GenBank中序列的一些物种18Sr RNA基因序列进行序列对比。结果表明，韭菜18Sr RNA基因序列与天门冬目的葱科、石蒜科、天门冬科的物种序列相似度高。论文绘制出韭菜18Sr RNA二级机构。本文对分子水平上韭菜资源的研究提供了资料。

关键词:  韭菜；天门冬目；18S rRNA；系统演化

目录

摘要

Abstract

1 绪论-1

1.1 基因组的研究和应用-1

1.1.1 基因组的研究进展-1

1.1.2 基因组DNA提取方法-1

1.1.3 植物基因组DNA提取的方法-2

1.1.4 基因组DNA的检测-2

1.2 rDNA的应用和研究进展-2

1.2.1 rDNA的定义-2

1.2.2 rDNA片段序列分析的研究方法-3

1.2.3 rDNA的序列分析及其应用-3

1.2.4 18SrDNA研究和应用-4

1.3 系统演化研究进展-5

1.4 本研究的意义-6

2 材料与方法-7

2.1 实验材料-7

2.1.1 主要仪器设备-7

2.2 实验方法-7

2.2.1 韭菜基因组DNA的提取-7

2.2.2 基因组DNA电泳检测-9

2.2.3 韭菜18SrDNA PCR反应体系-11

2.2.4 克隆测序-11

2.2.5 序列分析-11

3结果与讨论-12

3.1 结果-12

3.1.1 韭菜基因组DNA提取-12

3.1.2 韭菜基因组DNA电泳-12

3.1.3 韭菜18SrDNA序列的测定-12

3.1.4 韭菜在天门冬目的系统演化分析-13

3.1.5 韭菜18S rRNA的二维结构预测-14

3.2讨论-14

3.2.1 韭菜基因组DNA提取方法分析-14

3.2.2 韭菜基因组DNA电泳方法的要点-15

3.2.4 韭菜在天门冬目的系统演化地位探讨-15

结论-17

致谢-18

参考文献-19