基于转录组测序的福寿螺（Pomacea canaliculata）微卫星标记开发.docx

摘要:福寿螺(Pomacea canaliculata)是严重危害我国生物多样性、生态系统以及农作物的入侵生物。微卫星（Microsatellites）又称简单重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR），是开展遗传多样性、杂交和基因渐渗等研究中的理想分子标记之一。本研究基于高通量测序技术获得福寿螺P. canliculata转录组数据，筛选获得的含有微卫星重复的序列，运用Primer Premier 5设计出11对福寿螺SSR引物，并对这11对引物进行了筛选，其中8对引物能在P. canaliculata中成功扩增；7对引物在近缘入侵物种P. maculata中成功扩增。本研究中筛选的SSR标记能够用于福寿螺的遗传多样性、种群遗传结构、杂交和基因渐渗等研究。

关键词：福寿螺；微卫星；入侵生物

目录

摘要

ABSTRACT

1.文献综述-1

1.1福寿螺概述-1

1.1.1福寿螺研究现状-1

1.2微卫星-2

1.2.1微卫星简介-2

1.2.2微卫星标记的获取方法-2

1.3基于转录组数据的微卫星标记开发研究现状-3

1.4本研究的目的与意义-3

2.基于转录组测序的福寿螺微卫星标记开发-5

2.1实验材料-5

2.1.1福寿螺样品-5

2.2实验仪器及试剂-5

2.2.1实验仪器-5

2.2.2实验试剂-5

2.3实验步骤-5

2.3.1DNA提取-5

2.3.2序列分析与微卫星引物设计-5

2.3.3福寿螺P. canaliculata微卫星筛选及跨种扩增-5

2.3.4基因分型检测-6

2.3.5数据分析-6

2.4结果与分析-6

2.4.1引物设计-6

2.4.2引物在两种福寿螺中的扩增结果-6

2.4.3基因分型结果-7

2.4.4微卫星位点的多态性分析-8

讨论-12

致谢-13

参考文献-14